Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSF3RQ99062 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms