Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC38A2Q96QD8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC38A2Q96QD8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms