Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms