Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM47Q96LD4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms