Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
LINC00208Q96KT6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms