Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC136Q96JN2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms