Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRIG1Q96JA1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG1Q96JA1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms