Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MTERF3Q96E29 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms