Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TM4SF18Q96CE8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms