Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1Q969G3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms