Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP13Q92995 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
USP13Q92995 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP13Q92995 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP13Q92995 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP13Q92995 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP13Q92995 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP13Q92995 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP13Q92995 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP13Q92995 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP13Q92995 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP13Q92995 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP13Q92995 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP13Q92995 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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