Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD50Q92878 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms