Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEDD1Q8NHV4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEDD1Q8NHV4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms