Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC9Q8NEP7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC9Q8NEP7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms