Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BHLHE23Q8NDY6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms