Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTC21AQ8NDW8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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TTC21AQ8NDW8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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TTC21AQ8NDW8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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TTC21AQ8NDW8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTC21AQ8NDW8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
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