Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APCDD1LQ8NCL9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms