Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HJURPQ8NCD3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms