Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD53Q8N9V6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms