Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DTX3Q8N9I9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms