Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROM2Q8N271 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROM2Q8N271 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms