Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL34Q8N239 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms