Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNE4Q8N205 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms