Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD4Q8IYR2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD4Q8IYR2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms