Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms