Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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RAB11FIP4Q86YS3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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RAB11FIP4Q86YS3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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RAB11FIP4Q86YS3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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RAB11FIP4Q86YS3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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RAB11FIP4Q86YS3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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RAB11FIP4Q86YS3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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RAB11FIP4Q86YS3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB11FIP4Q86YS3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB11FIP4Q86YS3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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