Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KCNMB4Q86W47 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNMB4Q86W47 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms