Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SETXQ7Z333 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms