Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STRCQ7RTU9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms