Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf139Q6ZV77 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms