Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC141Q6ZP82 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC141Q6ZP82 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms