Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCBE1Q6UXH8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms