Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED9Q6R2W3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED9Q6R2W3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms