Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms