Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDD2Q6NTF9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD2Q6NTF9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms