Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms