Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCTP1Q6DN14 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCTP1Q6DN14 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms