Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS3Q68E01 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS3Q68E01 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms