Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
C9orf84Q5VXU9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC29■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC29■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C9orf84Q5VXU9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms