Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 HIST2H4B-201ENST00000579512 1132 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CHIC1Q5VXU3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHIC1Q5VXU3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms