Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms