Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC39AQ5SRH9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC39AQ5SRH9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms