Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD4BQ5PRF9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD4BQ5PRF9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD4BQ5PRF9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD4BQ5PRF9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD4BQ5PRF9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD4BQ5PRF9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD4BQ5PRF9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD4BQ5PRF9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD4BQ5PRF9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SAMD4BQ5PRF9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD4BQ5PRF9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms