Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEP78Q5JTW2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms