Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB41Q5JT25 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms