Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ESCO2Q56NI9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ESCO2Q56NI9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms