Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SBK1Q52WX2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SBK1Q52WX2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms