Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP28Q4G0W2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP28Q4G0W2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms