Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N0

GGTA1P, Inactive N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1PQ4G0N0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGTA1PQ4G0N0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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