Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLFNL1Q499Z3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms